ANALISIS TNFR1 SEBAGAI PROTEIN TARGET PADA UJI ANTIKANKER BERAS HITAM (Oriyza sativa L.) SECARA IN SILICO

Fadjar, Kurnia Hartati and Arlin, Besari Djauhari (2020) ANALISIS TNFR1 SEBAGAI PROTEIN TARGET PADA UJI ANTIKANKER BERAS HITAM (Oriyza sativa L.) SECARA IN SILICO. PROSIDING SEMNAS PERTANIAN 2020.

	Text (Cover) 0. Cover+Daftar Isi.pdf Download (1MB)
	Text (Full Paper) 5_Fadjar Kurnia Hartati.pdf Download (746kB)

Abstract

Penelitian ini mempunyai tujuan untuk mengetahui prediksi TNFR1 sebagai protein target pada uji antikanker beras hitam secara in silico. Metode penelitian menggunakan website PDP, KEGG, STRING dan COFACTOR server. Hasil penelitian menunjukkan bahwa TNFR1 merupakan reseptor/protein target yang meninduksi apoptosis sel dengan pathway melalui beberapa jalur seperti IKBKB, TNFRSF, TRAF dan lain-lain. TNFR1 akan berikatan dengan ligan pada asam amino-asam amino Phe60, Thr61, Ala62, Leu67, Leu71. Sisi aktif tersebut mempunyai kekuatan ikatan dengan ligan sebesar 0,52 berarti ikatannya sangat kuat karena ikatan antara protein target -ligan dikatakan kuat apabila mempunyai nilai antara 0-1. Nilai BS (Binding Site) lebih besar dari 1,94 yang berarti mempunyai tingkat akurasi tinggi. Nilai TM (template modelling) sebesar 1, dan nilai RMSD (Root Mean Square Deviation) sebesar 0.

Actions (login required)

View Item